薄層色譜（TLC）是一種非常有用的跟蹤反應的手段，還可以用于柱色譜分離中合適溶劑的選擇。薄層色譜常用的固定相有氧化鋁或硅膠，它們是極性很大（標準）或者是非極性的（反相）。流動相則是一種極性待選的溶劑。在大多數實驗室實驗中，都將使用標準硅膠板。將溶液中的反應混合物點在薄板上，然后利用毛細作用使溶劑（或混合溶劑）沿板向上移動進行展開。

　　柱層法棒狀薄層色譜根據混合物中組分的極性，不同化合物將會在薄板上移動不同的距離。極性強的化合物會“粘”在極性的硅膠上，在薄板上移動的距離比較短。而非極性的物質將會在流動的溶劑相中保留較長的時間從而在板上移動較大的距離。化合物移動的距離大小用Rf值來表達。這是一個位于0~1之間的數值，它的定義為：化合物距離基線（點樣時已經確定）的距離除以溶劑的前鋒距離基線的距離。

　　柱層法棒狀薄層色譜實驗步驟：

　　1）切割薄板。通常，買來的硅膠板都是方形的玻璃板，需要用鉆石頭玻璃刀按照模板的形狀進行切割。在切割玻璃之前，用尺子和鉛筆在薄板的硅膠面上輕輕地標出基線的位置（注意不要損壞硅膠面）。借助鋒利的玻璃切割刀和一把引導尺，你便可方便地進行玻璃切割。當整塊玻璃被切割后，你就可以進一步將其分成若干獨立的小塊了。

　　（開始的時候，也許你會感到有一些難度，但經過一些訓練以后，你便會熟練地掌握該項技術。）

　　2）選取合適的溶劑體系。化合物在薄板上移動距離的多少取決于所選取的溶劑不同。在戊烷和己烷等非極性溶劑中，大多數極性物質不會移動，但是非極性化合物會在薄板上移動一定距離。相反，極性溶劑通常會將非極性的化合物推到溶劑的前段而將極性化合物推離基線。